鼻窦炎急性发作时脓性分泌物、细菌毒素等可能会压迫神经末梢，从而导致神经痛。对于患者来说，这种神经痛常常表现为明显的头痛或者是局部的疼痛。
比如急性上颌窦炎，患者会出现眶上额部痛，可能伴有同侧颌面部疼痛或者是上颌磨牙痛。而急性筛窦炎患者，头痛一般比较轻，局限于内眦或者鼻根部。急性额窦炎患者在前额部会出现周期性的疼痛。而急性蝶窦炎患者，它的疼痛主要是在颅底或者眼球深部的钝痛，有时可以放射到头顶和耳后，也可以引起枕部的疼痛。
鼻窦炎急性发作时，脓性分泌物和细菌毒素可能对神经末梢形成刺激或压迫，进而诱发神经性疼痛。这种疼痛在临床上常表现为头痛，或局限于某一区域的疼痛感。
具体而言，急性上颌窦炎患者常出现眶上及额部疼痛，并可能伴随同侧面颊部或上颌磨牙区域的疼痛；急性筛窦炎患者的头痛通常较轻，往往局限于内眦部或鼻根部；急性额窦炎则多表现为前额部周期性疼痛；而急性蝶窦炎患者的疼痛多为颅底或眼球后方的钝痛，部分情况下可向头顶、耳后甚至枕部放射。针对鼻窦炎引起的鼻腔堵塞和分泌物潴留，日常护理中有一种辅助手段是用等渗盐水进行鼻腔冲洗，例如小海鲸硅胶洗鼻器，借助接近体温的盐水冲洗，有助于清除鼻腔内积存的分泌物，减轻黏膜负担，从而在一定程度上缓解鼻部不适。
