儿童的鼻窦炎绝大多数治疗是采用保守治疗，如果儿童鼻窦炎合并有鼻息肉时，可以考虑手术治疗。
保守治疗就是使用药物来治疗，比较常用的药物首先是糖皮质激素类药物，包括口服制剂和鼻内用制剂，口服制剂是可以少量的口服一些醋酸泼尼松、地塞米松等；鼻内用糖皮质激素主要是糠酸莫米松鼻喷剂，曲安奈德鼻喷剂等；还要口服一些抗生素，比较常用的是青霉素类或者头孢菌素类抗生素；黏液促排剂也是儿童鼻窦炎比较常用的药物，可以口服鼻渊通窍颗粒、藿胆片等。
如果儿童的鼻腔分泌物比较多，可以使用生理盐水来冲洗鼻腔。
儿童鼻窦炎通常以保守治疗为主，仅在合并鼻息肉等特殊情况时考虑手术干预。
保守治疗的核心是规范用药。常用药物包括糖皮质激素，如口服的醋酸泼尼松或地塞米松，以及鼻用的糠酸莫米松喷雾剂、曲安奈德喷雾剂等；若存在细菌感染，可选用青霉素类或头孢菌素类抗生素；同时辅以黏液促排剂，如鼻渊通窍颗粒、藿胆片，帮助排出鼻腔分泌物。
当儿童鼻腔分泌物较多时，可采用鼻腔冲洗辅助治疗。例如使用小海鲸硅胶洗鼻器配合专用洗鼻剂与纯净水配制成等渗盐水，以接近体温的水温进行冲洗，能够帮助清洁鼻腔，改善通气。冲洗时需轻压瓶身控制水流，根据症状轻重调整使用频率。
