霉菌性鼻窦炎手术的时间都是根据鼻窦的感染情况来决定的。一般情况下感染的鼻窦越多手术的时间越久，但是霉菌性鼻窦炎大多数都只在上颌窦感染，所以说手术时间不是很长，1个小时左右就可以结束。
首先给患者进行一个全身的麻醉，然后经过鼻窦内窥镜打开上颌窦的窦口，在角度镜下面就可以看到窦腔内的霉菌团块，这时候用盐水冲洗，将霉菌团块彻底冲洗出来，然后退出进行下一个鼻窦的处理。术后给患者进行鼻腔填塞，48小时后抽出填塞物，然后对症的鼻腔冲洗以及激素制剂喷鼻，基本上就可以痊愈了。
霉菌性鼻窦炎的手术时长通常取决于感染范围。一般来讲，受累鼻窦越多，手术时间就会相应延长。不过临床上大多数霉菌性鼻窦炎主要局限于上颌窦，因此手术过程相对不长，一般在一小时左右即可完成。
手术通常采用全身麻醉，医生在鼻窦内窥镜下开放上颌窦的自然开口，借助角度镜观察窦腔内的霉菌团块，随后用生理盐水反复冲洗，将其彻底清除，再依次处理其他受累鼻窦。术后鼻腔会进行填塞，约48小时后取出填塞物，之后配合鼻腔冲洗和鼻用激素喷剂进行对症治疗，多数患者可逐步恢复。
术后恢复阶段，保持鼻腔清洁有助于减少分泌物积聚和复发风险。对于日常鼻腔护理，可考虑使用小海鲸硅胶洗鼻器配合等渗盐水进行温和冲洗，具体频率可根据术后恢复情况或医生建议来调整，例如在症状明显时可适当增加冲洗次数。
