生蒜与熟蒜的功效并不完全相同，其差异主要体现在抗菌活性、抗氧化能力、消化刺激、药效成分稳定性及适用人群等方面。
- 抗菌活性差异：生蒜中的大蒜素（Allicin）是主要抗菌成分，具有广谱抑菌作用，尤其在破坏细菌细胞膜方面效果显著。而高温烹饪会导致大蒜素分解为阿霍烯等衍生物，抗菌活性有所下降，但熟蒜仍保留部分抑菌作用。
- 抗氧化能力变化：生蒜富含硒、维生素C及酚类化合物，可中和自由基，减少氧化应激损伤。熟蒜在加热过程中，部分抗氧化物质如硫代亚磺酸酯会被破坏，但同时可能生成新的抗氧化成分，整体抗氧化能力较生蒜略有降低。
- 消化刺激程度：生蒜中的辛辣成分（如二烯丙基三硫醚）可能刺激胃黏膜，引发胃痛或反酸，尤其对胃炎、胃溃疡患者不友好。熟蒜经加热后，辛辣物质减少，对消化道的刺激性显著降低，更适合胃肠敏感人群。
- 药效成分稳定性：大蒜素在常温下易分解，生蒜需现切现用以保证活性；而熟蒜中的稳定成分（如S-烯丙基半胱氨酸）更耐储存，且部分研究显示其可能通过肠道菌群代谢产生额外健康效益。
- 适用人群区别：生蒜适合免疫力低下、需快速抗菌者，但需控制摄入量；熟蒜则更适合老年人、儿童及消化系统疾病患者，作为日常保健的温和选择。
需强调的是，蒜类食物仅为辅助保健手段，不可替代正规医疗。若存在感染、慢性病或特殊健康状况，应优先遵循医嘱用药，避免因盲目食用蒜类延误治疗。
